棉花苗期是指从出苗到现蕾的时间段，期间棉花主要以营养生长为主，即吸收的营养用在根、茎和叶的生长。因此，棉花苗期管理的主攻目标是加强田间管理，改善棉苗的生育环境，减少不良自然因素的影响，保全苗、防病苗，培育壮苗。
1、及时查苗补种
棉种播后应及时查苗，发现漏播，应及时补种；未出苗时，发现烂芽、烂籽，应催芽补种；出苗后应及时检查出苗情况，发现缺苗断垄时应尽早采取措施及早补种。补种时应进行浸种催芽，以加快出苗，提高棉苗的整齐度。对缺苗处的补种要适当稀疏，补种时要用湿土封住出穴口，保证种子周边的土壤有适度的水分，加快生长。一般缺苗50厘米以下的可不进行补种，以充分发挥棉花自身的补偿能力。
2、放苗、定苗
（1）及时放苗。出苗后适时放苗是保证苗全、匀、齐、壮的关键，放苗时应注意以下几点：一是放绿不放*，即在棉花子叶由*变绿时及时打孔放苗。放苗作业的时间宜在上午10点前和下午4点后或全阴天进行，最好避开中午的大太阳。同时放苗后，应及时用湿土盖好膜孔，以防大风揭膜，跑墒降温。
（2）适时定苗。棉苗显行后要及时定苗，定苗作业应注意以下几点。一是棉苗1-2片真叶展开时进行定苗，坚持留大去小，留壮去弱，留健去病，保证苗匀、苗齐、苗壮。杜绝留双株和一穴多株，并同时去除杂草。缺苗处两端可留双株或补苗，严防形成高脚苗。
3、及时破除土壤板结
棉花播后遇雨和出苗处形成板结时，使用滚筒及时破除板结，以利于棉苗出土。
4、适时中耕
棉花从播种到现蕾时要保质保量中耕2-３次，以提高土壤的温度和渗透性，防止土壤板结，增强根系吸收营养和水分的能力，减少病虫草害的发生，促进幼苗的生长发育。第一次中耕在定苗后进行，深度8—10cｍ；第二次在现蕾前进行，中耕深度10-12cｍ。若苗期遇降水，应在雨后适时进行中耕，以防止土壤板结。中耕时要做到土壤平整、松碎，不埋苗、伤苗、铲苗，不拉沟、不拉膜。
5、化调
第一次化调：一般棉苗2-3叶龄后进行，亩用甲哌鎓（缩节胺）0.3-0.5克，达到控制果枝始节以下棉株自然高度，促进根系发育，提高叶片光合强度和能力，培育壮苗的目的。
第二次化调：一般棉苗5-7叶龄后进行，每亩用甲哌鎓（缩节胺）0.8-1克。其目的是控制棉株节间长度和促进花芽分化。
6、喷施叶面肥
针对长势较弱或晚发棉苗，每亩用尿素g+营养型植物生长调节剂适量兑水30公斤进行2～3次叶面喷施，以促进棉苗早生快发。
7、做好以棉蓟马、棉蚜为重点的虫害防治
（1）棉蓟马防治
对晚播或常年棉蓟马危害偏重的棉田（百株有虫达5株以上），应选用啶虫脒或吡虫啉等内吸性高效低*农药，进行喷雾防治，防治棉蓟马危害造成的多头棉或无头棉。
（2）棉蚜防治
发现中心蚜株或中心点片时，可用洗尿合剂（洗衣粉：尿素：水=1:1:）喷雾挑治，最大限度保护天敌、增益控害，促使益害比向良性生态方向发展，以提高防治效果。
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